崇明海事局（前身为上海崇明海事处，于1999年9月28日成立）于2013年7月1日正式挂牌成立，为中华人民共和国上海海事局下属分支局，基本定位为B类海事局，现设内设机构5个：办公室、政治处、综合业务处、执法督察处、指挥中心，处室办事机构2个：政务中心、船舶安全检查中心，海巡执法大队4个：南门海巡执法大队、长兴海巡执法大队、北支海巡执法大队、横沙海巡执法大队。